Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
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Nek3Q9R0A5 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Nek3Q9R0A5 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Nek3Q9R0A5 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Nek3Q9R0A5 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Nek3Q9R0A5 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Nek3Q9R0A5 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Nek3Q9R0A5 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Nek3Q9R0A5 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Nek3Q9R0A5 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Nek3Q9R0A5 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Nek3Q9R0A5 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms