Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gpc6Q9R087 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms