Protein–RNA interactions for Protein: Q9R059

Fhl3, Four and a half LIM domains protein 3, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhl3Q9R059 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Fhl3Q9R059 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fhl3Q9R059 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fhl3Q9R059 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fhl3Q9R059 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fhl3Q9R059 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fhl3Q9R059 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fhl3Q9R059 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Fhl3Q9R059 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fhl3Q9R059 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fhl3Q9R059 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fhl3Q9R059 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fhl3Q9R059 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fhl3Q9R059 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fhl3Q9R059 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fhl3Q9R059 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fhl3Q9R059 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fhl3Q9R059 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fhl3Q9R059 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fhl3Q9R059 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fhl3Q9R059 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fhl3Q9R059 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fhl3Q9R059 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fhl3Q9R059 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms