Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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