Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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