Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms