Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms