Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 189.7 ms