Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms