Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.8 ms