Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rnf6Q9DBU5 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rnf6Q9DBU5 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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