Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms