Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms