Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms