Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms