Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Nop56Q9D6Z1 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Nop56Q9D6Z1 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Nop56Q9D6Z1 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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