Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms