Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms