Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Ccdc47Q9D024 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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