Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
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