Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms