Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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