Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms