Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
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PompQ9CQT5 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PompQ9CQT5 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PompQ9CQT5 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PompQ9CQT5 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PompQ9CQT5 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PompQ9CQT5 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PompQ9CQT5 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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PompQ9CQT5 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PompQ9CQT5 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PompQ9CQT5 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PompQ9CQT5 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PompQ9CQT5 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PompQ9CQT5 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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PompQ9CQT5 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PompQ9CQT5 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PompQ9CQT5 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PompQ9CQT5 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PompQ9CQT5 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PompQ9CQT5 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PompQ9CQT5 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PompQ9CQT5 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PompQ9CQT5 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PompQ9CQT5 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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PompQ9CQT5 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PompQ9CQT5 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
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PompQ9CQT5 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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PompQ9CQT5 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PompQ9CQT5 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PompQ9CQT5 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PompQ9CQT5 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PompQ9CQT5 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PompQ9CQT5 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PompQ9CQT5 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PompQ9CQT5 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PompQ9CQT5 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PompQ9CQT5 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PompQ9CQT5 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PompQ9CQT5 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PompQ9CQT5 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PompQ9CQT5 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PompQ9CQT5 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PompQ9CQT5 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PompQ9CQT5 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PompQ9CQT5 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PompQ9CQT5 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PompQ9CQT5 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PompQ9CQT5 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PompQ9CQT5 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PompQ9CQT5 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PompQ9CQT5 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PompQ9CQT5 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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