Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 157 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Nudcd2Q9CQ48 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
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