Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms