Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms