Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
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Cldn16Q925N4 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
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Cldn16Q925N4 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
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Cldn16Q925N4 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
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Cldn16Q925N4 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
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