Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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