Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCZ8

Rpusd1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd1Q8VCZ8 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd1Q8VCZ8 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd1Q8VCZ8 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd1Q8VCZ8 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd1Q8VCZ8 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd1Q8VCZ8 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd1Q8VCZ8 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd1Q8VCZ8 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd1Q8VCZ8 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd1Q8VCZ8 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd1Q8VCZ8 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd1Q8VCZ8 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd1Q8VCZ8 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd1Q8VCZ8 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd1Q8VCZ8 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd1Q8VCZ8 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd1Q8VCZ8 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd1Q8VCZ8 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd1Q8VCZ8 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd1Q8VCZ8 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd1Q8VCZ8 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd1Q8VCZ8 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd1Q8VCZ8 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd1Q8VCZ8 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd1Q8VCZ8 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd1Q8VCZ8 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd1Q8VCZ8 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd1Q8VCZ8 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd1Q8VCZ8 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd1Q8VCZ8 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd1Q8VCZ8 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd1Q8VCZ8 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd1Q8VCZ8 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd1Q8VCZ8 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd1Q8VCZ8 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd1Q8VCZ8 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd1Q8VCZ8 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd1Q8VCZ8 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd1Q8VCZ8 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd1Q8VCZ8 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd1Q8VCZ8 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd1Q8VCZ8 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd1Q8VCZ8 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd1Q8VCZ8 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd1Q8VCZ8 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd1Q8VCZ8 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd1Q8VCZ8 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd1Q8VCZ8 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd1Q8VCZ8 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd1Q8VCZ8 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd1Q8VCZ8 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd1Q8VCZ8 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd1Q8VCZ8 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd1Q8VCZ8 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd1Q8VCZ8 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd1Q8VCZ8 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd1Q8VCZ8 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd1Q8VCZ8 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd1Q8VCZ8 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd1Q8VCZ8 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd1Q8VCZ8 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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