Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms