Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms