Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Colec12Q8K4Q8 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Colec12Q8K4Q8 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
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Colec12Q8K4Q8 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Colec12Q8K4Q8 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms