Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms