Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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FgbQ8K0E8 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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FgbQ8K0E8 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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FgbQ8K0E8 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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FgbQ8K0E8 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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FgbQ8K0E8 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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FgbQ8K0E8 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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