Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms