Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms