Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Brf1Q8CFK2 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Brf1Q8CFK2 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Brf1Q8CFK2 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Brf1Q8CFK2 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Brf1Q8CFK2 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Brf1Q8CFK2 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Brf1Q8CFK2 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Brf1Q8CFK2 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Brf1Q8CFK2 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Brf1Q8CFK2 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Brf1Q8CFK2 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Brf1Q8CFK2 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Brf1Q8CFK2 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Brf1Q8CFK2 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Brf1Q8CFK2 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Brf1Q8CFK2 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Brf1Q8CFK2 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Brf1Q8CFK2 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Brf1Q8CFK2 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Brf1Q8CFK2 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Brf1Q8CFK2 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Brf1Q8CFK2 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Brf1Q8CFK2 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Brf1Q8CFK2 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Brf1Q8CFK2 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Brf1Q8CFK2 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Brf1Q8CFK2 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Brf1Q8CFK2 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Brf1Q8CFK2 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Brf1Q8CFK2 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Brf1Q8CFK2 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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