Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms