Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Nup88Q8CEC0 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Nup88Q8CEC0 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Nup88Q8CEC0 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Nup88Q8CEC0 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Nup88Q8CEC0 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Nup88Q8CEC0 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Nup88Q8CEC0 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Nup88Q8CEC0 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Nup88Q8CEC0 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Nup88Q8CEC0 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Nup88Q8CEC0 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Nup88Q8CEC0 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Nup88Q8CEC0 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nup88Q8CEC0 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nup88Q8CEC0 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nup88Q8CEC0 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nup88Q8CEC0 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Nup88Q8CEC0 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Nup88Q8CEC0 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nup88Q8CEC0 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nup88Q8CEC0 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nup88Q8CEC0 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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