Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spef2Q8C9J3 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms