Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms