Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Cxcl10-201ENSMUST00000038816 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Olfr1445-201ENSMUST00000049624 1001 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Olfr1461-201ENSMUST00000053772 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Vmn1r230-201ENSMUST00000053974 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Olfr1287-201ENSMUST00000075390 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 H2-M9-202ENSMUST00000087167 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Trim35Q8C006 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Trim35Q8C006 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Trim35Q8C006 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Trim35Q8C006 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Trim35Q8C006 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 4930505M18Rik-201ENSMUST00000175854 1288 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Trim35Q8C006 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Trim35Q8C006 AC156560.1-201ENSMUST00000221425 256 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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Trim35Q8C006 Aamdc-201ENSMUST00000042627 627 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Trim35Q8C006 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Trim35Q8C006 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gm17146-201ENSMUST00000108464 372 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gm26194-201ENSMUST00000175036 71 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gm21758-201ENSMUST00000179336 819 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gm6098-201ENSMUST00000180234 330 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 6530403H02Rik-203ENSMUST00000183168 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gm29647-201ENSMUST00000188795 666 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gm28504-201ENSMUST00000190977 666 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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