Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI0

Fbxo38, F-box only protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo38Q8BMI0 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms