Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

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Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Usp1Q8BJQ2 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Usp1Q8BJQ2 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Usp1Q8BJQ2 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Usp1Q8BJQ2 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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Usp1Q8BJQ2 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Usp1Q8BJQ2 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Usp1Q8BJQ2 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Usp1Q8BJQ2 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Usp1Q8BJQ2 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Usp1Q8BJQ2 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Usp1Q8BJQ2 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Usp1Q8BJQ2 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Usp1Q8BJQ2 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms