Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
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