Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Tsc22d1-207ENSMUST00000140251 670 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Ttc28Q80XJ3 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Ttc28Q80XJ3 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Ttc28Q80XJ3 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Ttc28Q80XJ3 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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