Protein–RNA interactions for Protein: Q80U57

Rims3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims3Q80U57 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms