Protein–RNA interactions for Protein: Q80U35

Arhgef17, Rho guanine nucleotide exchange factor 17, mousemouse

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Length 2,057 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef17Q80U35 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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