Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LnpkQ7TQ95 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms